BIOME-Bench:用于多组学分析的LLM基准

发布:2025年12月31日 09:01
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ArXiv

分析

本文介绍了 BIOME-Bench,这是一个新的基准,旨在评估大型语言模型 (LLM) 在多组学数据分析中的表现。它解决了现有通路富集方法的局限性以及缺乏用于评估该领域 LLM 的标准化基准的问题。该基准侧重于两个关键能力:生物分子相互作用推断和多组学通路机制阐明。本文的重要性在于提供了一个标准化的框架,用于评估和改进 LLM 在生物学研究关键领域的表现,这可能导致对复杂生物数据的更准确和有见地的解释。

引用

实验结果表明,现有模型在多组学分析中仍然存在重大缺陷,难以可靠地区分细粒度的生物分子关系类型,也难以生成忠实、稳健的通路级机制解释。