基因组重排距离的近似

发布:2025年12月31日 18:06
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ArXiv

分析

本文探讨了计算基因组之间距离的问题,考虑了各种重排操作(反转、转座、插入/缺失)、基因方向、基因间区域长度以及操作权重。这在生物信息学中是一个重要的问题,用于比较基因组和理解进化关系。本文的贡献在于为这个复杂的问题提供了近似算法,这至关重要,因为找到精确的解决方案通常在计算上是难以实现的。使用 Labeled Intergenic Breakpoint Graph 是他们方法中的一个关键要素。

引用

本文介绍了一种算法,该算法在考虑操作的某些权重集时具有保证的近似值。