HELM-BERT：HELM表記を用いたペプチド特性予測

本論文は、治療用ペプチドの特性を予測するための新しい言語モデルHELM-BERTを紹介しています。ペプチド構造の複雑さに対処するために、モノマー組成と接続性を明示的に表現するHELM表記法を利用しています。このモデルは、SMILESベースのモデルよりも優れた性能を示し、ペプチドモデリングにおけるHELMの表現の利点を強調し、低分子とタンパク質言語モデル間のギャップを埋めています。

• •HELM-BERTは、ペプチド特性予測のための新しい言語モデルです。
• •既存のモデルの限界を克服するためにHELM表記法を利用しています。
• •HELM-BERTは、下流タスクにおいてSMILESベースのモデルよりも優れています。
• •HELMの表現は、ペプチドモデリングにデータ効率の利点を提供します。